Hay muchas causas diferentes de la intolerancia a la lactosa, siempre consulte el consejo de un profesional de la salud si siente que su bebé es intolerante a la lactosa. Algunas de las causas incluyen:

- Congénita - Significa intolerancia a la lactosa desde el nacimiento, debido a la deficiencia de la enzima lactasa
- Gastroenteritis - Diarrea aguda
- Infeccion parásita
- Deficiencia de hierro